二種微衛星不穩定性檢測方法
1. 聚合酶連鎖反應法(PCR-Based Method),利用五個微衛星的標記。其中含二個單核苷酸(BAT-25,BAT-26) 及三個雙核苷酸(D2S123,D5S346與 D17S250)。五個標記中有任何二個以上不穩定,就可以稱為高度的微衛星不穩定(MSI-H),有任何一個不穩定, 則為低度微衛星不穩定(MSI-L)。 若五個都穩定則稱為微衛星穩定者 (MSS)。
2. 免疫組織染色(Immunohistochemistry),主要是針對四種錯配修復蛋白(MLH1,MSH2,MSH6及 PMS2)進行檢測。若有任何一個蛋白的缺失,則為高度的微衛星不穩定 (MSI-H);若四個蛋白都無缺失,則可認為低度微衛星不穩定(MSI-L)/ 微衛星穩定者(MSS)。
不管是以聚合酶連鎖反應法還是免疫組織染色法來檢測MSI,其敏感性可以達90%以上,而特異性則可接近 100%。但是相對而言,免疫組織染色法是一個較簡單快捷又不昂貴的方法。